ENCRYPTED RESEARCH TRANSFER

三维基因组方法

Hi-C通过空间邻近连接读取染色质接触。矩阵需要经过距离背景、技术偏差和分辨率处理，才能用于区室与结构域分析。

接触矩阵

区分原始计数、标准化矩阵和观察/期望矩阵。

结合相关矩阵和特征向量描述长距离接触环境。

使用DI、HMM或绝缘分数观察局部结构。